En julio de 1944 resultaron hundidos 6 U-Boote con Schnorchel en el Canal y en agosto tres, hasta que se suspendieron las operaciones. Los U-Boote de Brest y Lorient fueron trasladados a La Pallice y Burdeos, y el resto enviados a Noruega. En tres meses de junio a agosto de 1944 se habían perdido 84 U-Boote: 19 en el Canal y 16 en el Golfo de Vizcaya. Entre junio y fines de 1944 se perdieron 112, incluyendo 27 en las bases francesas: autohundidos o vícitimas de bombardeos.

A diferencia de los ingleses, italianos y japoneses, los alemanes concibieron sus primeros "submarinos enanos" como puros medios de defensa y, de hecho, para cuando fueron construidos, esa era la única misión que cabía esperar de ellos. Los primeros modelos (Neger -2,75 toneladas, autonomía de 48 millas a 4 nudos- y Marder, 3 toneladas, sólo se distinguía del anterior por tener el morro más largo, quedando así la cabeza del torpedo algo más atrás) consistían en un torpedo arrastrado por un cuerpo igualmente cilíndrico, que sólo llevaba motor eléctrico y una cúpula de plexiglas desde la que el conductor podía observar. En 1944 se construyeron unos 200 Neger -el nombre aludía a su diseñador, el ingeniero de torpedos Mohr, "moro" en argot- y a partir de julio unos 300 Marder ("marta"; algunas fuentes hablan de 500 hasta el fin de la guerra).

El 22 de noviembre de 1943 cayó en manos de los alemanes un minisubmarino -auténtico, no un "torpedo tripulado"- monoplaza inglés del tipo Welman (en concreto el W46: no hay que confundirlo con los X-Crafts que operaron al mismo tiempo contra el Tirpitz). Copiando su diseño surgió el Adam (construido del 9 de febrero al 15 de marzo de 1944), prototipo del monoplaza Biber ("castor" de 6,5 toneladas), que llevaba dos torpedos y del que se encargaron 24 unidades (llegaron a construirse 324) tras las primeras pruebas realizadas con éxito el 29 de marzo de 1944.

Tras el fracaso de los U-Boote contra la invasión, se daría paso a los grupos de submarinos "pequeños" (K-Verbände) creados a fines de 1943. El 5 de julio 26 de los 40 Neger estacionados al oeste de Honfleur salieron del estuario del Sena para atacar a los barcos enemigos: sólo regresaron 9, y hundieron dos minadores ingleses (HMS Magic y HMS Cato, ambos de la clase Catherine con 1.110 toneladas de desplazamiento). Entre la noche del 7 y el día 9 otros 21 Neger salieron, hundiendo al minador británico HMS Pylades -del mismo tipo que los anteriores- y dañando al crucero polaco (ex británico) ORP Dragon, posteriormente usado para formar el puerto artificial Mulberry: ninguno de los Neger regresó en esta ocasión.

La siguiente operación correspondió a los Marder, que en la noche del 2 al 3 de agosto atacaron a las fuerzas anglo-canadienses en Courseulles-sur-Mer. De 58 regresaron 17 (12 según algunas fuentes), habiendo hundido un barco Liberty (7.219 TRB), un minador y el destructor HMS Quorn (907 toneladas), aparte de dañar un crucero y un transporte de 7.000 TRB. De nuevo un grupo de 42 Marder salió en la noche del 16 al 17. Dos de ellos atacaron al acorazado francés Courbet (23.189 toneladas) que estaba varado desde el 9 de julio -según algunas fuentes desde el 10 de junio- como rompeolas del Mulberry, y se usaba sólo como almacén. Además hundieron un barco-anclaje para globos aerostáticos de 757 toneladas (HMS Fratton) y una lancha de desembarco de 415 toneladas. 26 de los Marder fueron hundidos y uno capturado.

El Molch ("salamandra") fue otro "submarino enano" monoplaza con dos torpedos diseñado para navegar en inmersión cerca de la costa. Con 11 toneladas, tenía sólo motor eléctrico, su autonomía era de 40 millas (74 km) a 5 nudos (9 km/h). El 12 de junio de 1944 se entregó la primera de las 393 unidades construidas en Bremen. 12 Molch (K-Verband 411) fueron empleados en la noche del 25 al 26 de septiembre de 1944 contra las unidades de la operación Dragoon (desembarco en la costa mediterránea francesa), sin obtener más resultado que la pérdida de 10 de los minisubmarinos.

Los submarinos del tipo XXVIIB (Seehund, "foca", también denominados tipo XXVIIB 5 y tipo 127) de 12 toneladas, semejantes a los X-Craft británicos, daban sólo 6 nudos en inmersión, frente a los 19 de los japoneses de tamaño parecido. Su ventaja era que difícilmente se les podía localizar con ASDIC.

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